Несмотря на неоднократные заявления режиссёра Д. Мостоу о бережном отношении к вселенной Терминатора, многие детали в сюжете третьей части не соответствуют фактам первых частей. Они могут быть логично объяснены, если исходить из того предположения, что после взрыва корпорации «Кибердайн Системс» изменился не только ход будущего, но и ход прошлого.

Замечены следующие противоречия.

• В момент фильма Джону Коннору — 23 года, хотя должно быть 19, так как он родился в 1985. Более того, говорится, что атаку второго терминатора он пережил в возрасте 13 лет, в то время как в фильме Камерона ему было 10 лет.
• Цвет лазерных лучей у терминаторов будущего не фиолетовый, а голубой.
• Другой вариант биографии Сары Коннор. По словам Джона, она умерла от лейкемии, заболев ещё до атаки второго терминатора. На её могиле указан ошибочный год рождения — 1959 вместо 1965.

Большой резонанс вызвало изменение концептуальных основ саги. В частности, центральная идея фильмов Кэмерона об ответственности людей за своё будущее («Нет судьбы, кроме той, которую мы творим») изменилась на прямо противоположную. Саму картину многие сочли только фильмом действия, без какого-либо философского или этического подтекста, а характерную реалистичность — принесенной в жертву показным спецэффектам. Серьёзное раскрытие характеров главных героев уступило место высмеиванию, фильм изобилует шутками и комическим обыгрыванием сцен из предыдущих частей.